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从前瞻性生物样本库到精准医学 “生物样本库-理性分子评价,创新药物筛选”-欧洲宫颈癌研究方案

发表时间:2016-01-11

从前瞻性生物样本库到精准医学 “生物样本库-理性分子评价,创新药物筛选”-欧洲宫颈癌研究方案

研究背景:宫颈癌是全球导致死亡的主要妇科恶性肿瘤,其死亡率仅次于乳腺癌。宫颈癌的活检组织及血液样本易于获得,对未来制定精准医学策略至关重要。

研究方案:生物样本库-理性分子评价,创新药物筛选(Biobanking-Rational molecular Assessment Innovative Drugselection BIO-RAIDs)是一项欧洲前瞻性多中心研究,目前正在欧洲六国招募患者。针对既往未经过治疗的宫颈癌患者(临床分期IB2-IV),在指定时间[1]采集肿瘤和体液标本。患者根据疾病的临床分期接受标准化初始治疗。本项目计划募集700例患者。项目的主要目标是期望发现可用于预测治疗反应或治疗抵抗相关的主要分子变化、信号通路激活状态以及肿瘤微环境模式。将采用二代测序技术、反向蛋白芯片技术以及免疫组化技术进行全面详尽的分子分析。

讨论:BIO-RAIDs的临床研究已经在计划参与国家启动,到目前为止招募到170位患者。本研究将对宫颈癌的精准治疗做出重要贡献。研究的结果将推进宫颈癌临床实践指南的发展,改善患者预后,提高患者的生存质量。

[1]指定时间:①治疗前活检;②治疗反应差或治疗无效的病例,在治疗过程中或治疗结束时活检;③发现复发时活检

图表:

图1:“RAIDs计划”参与国家

RAIDs是集医学院、中小型企业及转化研究平台于一体的国际多学科合作中心。共7个欧洲国家参与“RAIDs计划”:法国、德国、新西兰、匈牙利、塞尔维亚、摩尔多瓦、罗马尼亚。“BIO-RAIDs研究”在其中的6个国家实施:法国、德国、新西兰、塞尔维亚、摩尔多瓦、罗马尼亚。

图2:推荐治疗方案及活检时间

募集宫颈癌IB2-IV期的未经治疗病人进行BIO-RAIDs研究并给予标准化治疗。推荐根据临床分期进行的标准治疗方案及活检样本采集时间:B1:治疗前活检;B2:治疗反应差或治疗无效的病例,在治疗过程中或治疗结束时活检;B3:发现复发时活检。

图3:从样本到检测的工作流程

患者样本(血样及活检样本)先集中在当地中心,随后送到检测平台,通过免疫组化、HPV插入及测序、反相蛋白芯片等方法予以分析处理。中心样本库的剩余标本将在SeqOmics(匈牙利)进行测序。

图4:知识与数据整合(KDI)

异质性的临床及生物分子数据的整合需要强大的信息系统。数据整合:所有数据(eCRF临床数据、生物学数据包括通过免疫组化分析获得的肿瘤微环境数据、HPV分型、gDNA和ctDNA的外显子组和靶向测序和反向蛋白芯片的原始数据)均整合到KDI核心系统中,而后高级研究功能将提供多种数据查询功能。异质性来源的数据通过该独特的生物信息学通道后将会产生新的整合知识。


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